★内部メカニックの可動を再現した「アクションメカニックモデル」と「完全な変形」を両立させたゼータガンダムの最高峰モデル。頭部カメラの他、計4箇所が発光。付属のビームサーベルも発光ギミック内蔵。バインダーを装着したままウェイブライダーに完全変形する、究極のゼータガンダム。エゥーゴとアナハイム・エレクトロニクス社による共同開発計画「Ζ計画」で開発された機体の一つ。リック・ディアス（γガンダム）から数えて4番目に開発されたため、その開発コード「ζ」からΖガンダムと名付けられた。宇宙世紀0087年、エゥーゴと協力関係にあったアナハイム社はリック・ディアスの完成と同時に次世代の高性能MS開発計画「Ζ計画」を発動させる。百式、メタスの試作後、アナハイム社はエゥーゴの象徴たる高性能機Ζガンダムの開発に着手したが難航。しかし、ティターンズが開発したガンダムMk-IIが同社に持ち込まれたことで状況は一変する。ガンダムMk-IIに採用されたムーバブルフレームの設計思想は斬新であり、可変MSに要求される機能を十分に備えたものであった。さらに民間人の少年カミーユ・ビダンによる変形機構やフライングアーマーの発案も加わり、設計は急速に進展していった（劇場版『機動戦士Ζガンダム A New Translation』ではカミーユが開発協力に携わった描写はない）。こうして完成したΖガンダムは「ウェイブライダー」（以下WR）と呼ばれる巡航形態への変形能力を有し、宇宙空間から重力下までの連続運用を可能とする破格の汎用性を実現した。本機のムーバブルフレームの基本構造はコピーが容易である上、ガンダムMk-II以上に高い強度を有しており、以後に開発されたMSのほとんどがどこかにこの構造を取り入れている。これによりΖガンダムは機体構造そのものを変更し、複数のミッションに迅速に対応することが可能となった。これは既存のMSを大きく凌駕する機能であり、便宜上第3世代MSに分類される。

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